1、氣相色譜柱材質的選擇：要求不與樣品起反應，而且易于彎曲，就當前使用情況來看，主要是不銹鋼和玻璃二種最為常用，以前有使用銅管的，但銅在化學性質上比較活潑，高溫下對某些物質有催化作用，所以現在基本上沒有人使用了。

2、氣相色譜內徑的選擇：就從理論上講內徑越小，柱效越高，但相反柱容量就會減少，目前常用的主要為：φ3和φ4的兩種。

3、長度的選擇：理論上柱效的塔板數與柱長的平方成正比，相反由于柱子長度的增加，分析時間也會相應地增加，常用的為0.5~5米左右的。

4、氣相色譜柱形狀的選擇：現在柱子形狀基本上是螺旋圈狀的，只是根據柱溫箱的大小不同圓的直徑有所不同罷了，為了克服徑向擴散的問題，一般情況下螺旋的直徑不能太小，以免降低柱效。當然對于短的柱子還是以U形為好！

5、柱子的清洗：柱子的清洗是一個很關鍵的步驟，它關系到柱子灌裝的質量問題，不銹鋼柱一般情況下先用10%鹽酸清洗后再用10%的熱堿洗，最后用水清洗到PH為7，烘干備用。玻璃柱用10%酸洗后，用水沖至PH為7，烘干備用。